上海二代測序診斷

1. 常見二代測序的3種測序方式的共同點有哪些

「普通的基因測序」應該是指「常規DNA測序」吧，是用Sanger法（也就是雙脫氧法）進行測序的方法，目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 進行的自動測序，基本上可以做到600bp-800bp的讀長。
高通量測序的概念其實是一個相對的概念，在2000年的時候，3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序，是相對手工測序或者跑平板膠來說的。
不過到2005年以後，高通量測序就改指第二代測序（Next generation sequencing），454、Solexa(後改為Illumina）和SOLiD等第二代測序，比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍，甚至上億倍，所以稱為高通量測序。
NGS的特點主要有：
1、通量高。一個RUN能產生500Mb-600Gb的數據量。
2、讀長相對較短。454(約400-500bp)，llumina（100-250bp），SOLiD（75-100）。
3、單位數據的成本非常低。現在很多項目測序的費用。已經非常低。生物信息分析成本變得更為重要了。

2. 二代測序的具體介紹

第二代測序技術的核心思想是邊合成邊測序（Sequencing by Synthesis)，即通過捕捉新合成的末端的標記來確定DNA的序列，現有的技術平台主要包括Roche/454 FLX、Illumina/Solexa Genome Analyzer和Applied Biosystems SOLID system。這三個技術平台各有優點，454 FLX的測序片段比較長，高質量的讀長（read）能達到400bp；Solexa測序性價比最高，不僅機器的售價比其他兩種低，而且運行成本也低，在數據量相同的情況下，成本只有454測序的1/10；SOLID測序的准確度高，原始鹼基數據的准確度大於99.94%，而在15X覆蓋率時的准確度可以達到99.999%，是目前第二代測序技術中准確度最高的。
更多內容詳見網路：http://ke..com/view/4990239.htm

3. 二代測序的具體流程

DNA提取-打斷-末端修復-add A-加接頭-PCR-上機檢測！

4. 基因檢測是做什麼的上海哪家做這個做得比較好

基因檢測是通過血液、其他體液或細胞對DNA進行測序的技術。可以診斷疾病，也可以用於疾病風險的預測。
目前上海做基因檢測的公司有很多，選擇哪一家基因檢測公司，要看個人需求，和所需要檢測的項目，建議選擇正規專業檢測機構來做，比如美吉醫學檢驗所。

5. 聽說基因管家用第二代測序技術做基因檢測准確率可以到99.5%，這是真的嗎

是的，第二代基因測序技術可以解讀30億的鹼基，數據量相當於60GB的「天書」（列印成冊相當於100本牛津大辭典），對個體攜帶的20000+個基因進行分析解讀，實現了真正意義上的個人基因組的全面檢測，准確率達到了99.5%.

6. 國內有沒有RNAseq、二代測序做的好的公司，推薦一個，感覺售後分析都很差

是的，國內做這個實驗的公司挺多，不過服務大多不怎麼樣。可以去上海生因生物做。我做過兩次，他們的比較專業。服務特別好。問題解決的很快。分析上的問題幾乎全部都給你解決。他們公司免費提供數據上傳GEO一類的服務。我之前在別的公司測的，都不提供。我也不會怎麼傳。他們公司完全不操心，直接上傳好。

7. 上海哪裡有做全基因組測序檢測靠譜的

全基因組測序不同於常規測序只測序部分鹼基對，而是360°檢測500種疾病風險，並結合功能醫學、再生醫學、抗衰老醫學進行健康管理及疾病預防。目前主流的是上海WA臻景醫療。疾病解析-就醫指導-定製膳食指南-定製生活方式-給家人健康建議。雖然基因風險不可改變，但可以改變生活方式，仍然保持健康。
希望可以幫到你

8. DNA 的 1代測序，2代測序，3代測序的區別是什麼啊

1. 第一代測序：指雙脫氧末端終止法，擴增後通過毛細管電泳讀取序列，每次獲取數據量少。
   

2. 第二代測序：為高通量測序，採用微珠或高密度晶元邊合成邊測序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次獲得數G數據，相對與第三代，都仍然需要擴增的方法放大信號，擴增後再檢測。
   

3. 第三代測序：特點是單分子測序，多基於納米科技，無需擴增，對單分鏈DNA/RNA直接用合成、降解、通過納米孔等方式直接測序，核心特點是無需擴增所以成本更低。

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DNA測序是指分析特定DNA片段的鹼基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）與鳥嘌呤的（G）排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。

在基礎生物學研究中，和在眾多的應用領域，如診斷，生物技術，法醫生物學，生物系統學中，DNA序列知識已成為不可缺少的知識。具有現代的DNA測序技術的快速測序速度已經有助於達到測序完整的DNA序列，或多種類型的基因組測序和生命物種，包括人類基因組和其他許多動物，植物和微生物物種的完整DNA序列。

9. 第二代DNA測序技術的操作流程

操作流程如下：

1、測序文庫的構建

首先准備基因組，然後將DNA隨機片段化成幾百鹼基或更短的小片段，並在兩頭加上特定的接頭。如果是轉錄組測序，則文庫的構建要相對麻煩些，RNA片段化之後需反轉成cDNA，然後加上接頭，或者先將RNA反轉成cDNA，然後再片段化並加上接頭。

2、錨定橋接

Solexa測序的反應在叫做flow cell的玻璃管中進行，flow cell又被細分成8個Lane，每個Lane的內表面有無數的被固定的單鏈接頭。上述步驟得到的帶接頭的DNA 片段變性成單鏈後與測序通道上的接頭引物結合形成橋狀結構，以供後續的預擴增使用。

3、預擴增

添加未標記的dNTP 和普通Taq 酶進行固相橋式PCR 擴增，單鏈橋型待測片段被擴增成為雙鏈橋型片段。通過變性，釋放出互補的單鏈，錨定到附近的固相表面。通過不斷循環，將會在Flow cell 的固相表面上獲得上百萬條成簇分布的雙鏈待測片段。

4、單鹼基延伸測序

在測序的flow cell中加入四種熒游標記的dNTP 、DNA聚合酶以及接頭引物進行擴增，在每一個測序簇延伸互補鏈時，每加入一個被熒游標記的dNTP就能釋放出相對應的熒光，測序儀通過捕獲熒光信號，並通過計算機軟體將光信號轉化為測序峰，從而獲得待測片段的序列信息。

5、數據分析

這一步嚴格來講不能算作測序操作流程的一部分，但是只有通過這一步前面的工作才顯得有意義。測序得到的原始數據是長度只有幾十個鹼基的序列，要通過生物信息學工具將這些短的序列組裝成長的Contigs甚至是整個基因組的框架，或者把這些序列比對到已有的基因組或者相近物種基因組序列上，並進一步分析得到有生物學意義的結果。

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第二代測序技術的核心思想是邊合成邊測序，即通過捕捉新合成的末端的標記來確定DNA的序列，現有的技術平台主要包括Roche/454 FLX、Illumina/Solexa Genome Analyzer和Applied Biosystems SOLID system。

Illumina/Solexa Genome Analyzer測序的基本原理是邊合成邊測序。在Sanger等測序方法的基礎上，通過技術創新，用不同顏色的熒游標記四種不同的dNTP，當DNA聚合酶合成互補鏈時，每添加一種dNTP就會釋放出不同的熒光，根據捕捉的熒光信號並經過特定的計算機軟體處理，從而獲得待測DNA的序列信息。

10. 老師，在上海開會的時候，聽說有兩種基因檢測的方法：測序法和AMS法，兩者怎麼解釋，有什麼不同

測序法分為第一代和第二代，現在有了第三代測序，第一代測序可以針對某些疾病做檢測，通量小，第二代測序通量高，可以同時做及時分樣本。第三代是單分子測序。
AMS法應該是質譜法，只能針對特定的位點，設計引物檢測。那些明確位點的基因可以做。