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華大基因數據分析平台

發布時間:2021-07-08 15:15:12

㈠ 小白求助,華大基因測序結果如何分析

目前國際上通用抄的基因組
De Novo
測序方法有三種:

1. 用Illumina Solexa GA IIx測序儀直接測序;

2. 用Roche GS FLX Titanium直接完成全基因組測序;

3.
用ABI 3730 或Roche GS FLX Titanium測序,搭建骨架,再用Illumina Solexa GA IIx進行深度測序,完成基因組拼接。

㈡ 華大基因的技術平台

華大基因憑借先進的測序和檢測技術、高效的信息分析能力、豐富的生物資源,搭建了世界先進的多技術平台,可實現從中心法則到結構與功能的貫穿研究,構建生物技術與信息技術相融合的網路體系。
本著大平台、大資源的方向,華大基因擁有測序平台、質譜平台、信息中心三大技術平台、資源庫。在2013年,華大基因還收購了人類全基因組精準測序的創新領導者Complete Genomics,豐富現有多種平台基礎上的基因組學研究技術,以強大的平台實力為科研工作者及大眾提供服務。 信息中心以實現超大規模生物信息學計算為中心任務,不斷提升其在高效能計算、雲計算服務能力,為海量數據處理提供創新解決方案。
華大基因擁有深圳、香港、北京、武漢、杭州等數個大型生物信息學超級計算中心,截至2014年5月,總峰值計算能力達到248 Tflops,總內存容量達到46.3TB,總存儲能力達到22.7PB。其中位於深圳和香港的集群的峰值計算能力分列國內生物信息領域第一和第二位,有能力為海量生物信息學數據的存儲、處理和分析提供穩定而高效的資源保障。

㈢ 深度測序的主要軟體有哪些華大基因測序的結果一般要怎麼處理

主要有兩類,一類是基於overlap graph的組裝軟體,有CABOG、ARACHNE、RePS、phrap及newbler等; 另一類是基於de bruijn graph的組裝軟體,有SOAPdenovo、Velvet、ALLPATHS、ABySS等。

說的華大基因測序的主要分析方法要看您做什麼了。。。高通量測序現在國內做的人多了去了,如果被人店大欺客的話,可以找我們

㈣ 華大基因的華大品牌

作為以領先的基因科技造福人類為宗旨的生物科技公司,華大基因憑借自身強大的硬體平台和人才資源,在9大領域為全球科研工作者提供創新型生物研究服務,為廣大普通民眾提供前沿生物科技在醫療、農業、環境等領域的應用服務。 華大基因研究院致力於基因組學、轉錄組學等多組學方面的公益性研究,研究內容涵蓋醫療健康、農業育種、環境等生命科學相關領域,目前主要進行個人基因組、腫瘤、生育健康和動植物分子育種四大項目的研究。
機構願景:實現基礎研究重大技術突破和領先技術開發,成為生物產業發展核心驅動力。
品牌大事記
2007年6月 深圳華大基因研究院成立
2011年7月 華大基因大數據期刊《Giga Science》雜志已經開始接收數據,並公開了首個可引用的資料庫—德國大腸桿菌資料庫。 華大科技專注於服務生命科學研究者、搭建全產業鏈服務網路,解決人類社會中的各類健康、能源、環境問題,致力於成為全球生命科學研究機構的首選合作夥伴。
機構願景:為科學家有效組織科研資源提供方向性信息支持;改善人類健康,保護環境,節約資源;建立全球合作網路,成為知識最重要的生產者。
品牌大事記
2009年8月 華大基因專門成立科技合作事業部,旨在為全球合作夥伴提供科技合作和服務。
2012年4月 華大基因科技服務有限公司正式成立,致力成為全球領先的生物科研解決方案提供者。
業務內容
華大科技依託多種成熟技術平台,服務於生命科學研究的各個領域,為全球從事生命科學研究的科研人員提供高質量的、行業領先的基因組學測序服務、基因分型、轉錄組學測序服務、表觀組學測序服務、蛋白質譜分析服務、Sanger測序及Oligo合成、生物雲計算等標准化的生物技術外包服務;除此外,我們還可以依據您的個性化需求提供定製化產品服務以及一站式全套的解決方案(Total Solution)。 華大醫學致力於以經濟、簡便的方式,將全球前沿的多組學科研成果應用於醫學檢測領域,以期大幅降低出生缺陷率,提高腫瘤等重大疾病的診療效果。華大醫學已開發出一系列基於多組學技術的檢測服務,形成了貫穿生命孕育、出生、發育、成長等全過程的全時全景產品圖譜。
品牌口號:我的基因我知道,我的健康我做主
機構使命:控制幾種病,造福千萬家
品牌大事記
2007年2月, 「華大健康(現華大醫學)事業部」正式成立;
2012年3月, 臨檢中心及胎兒與生殖健康中心合並,華大健康(現華大醫學)成立;
2014年3月,「華大健康」正式更名為「華大醫學」。 華大農業研究范圍覆蓋植物、動物、微生物、海洋四大領域,現擁有達到國際先進水平、設備/儀器齊全、管理完善的各類生物學和育種實驗室、玻璃溫室及近千畝的育種基地和產業化基地,致力於推動新興農業經濟發展。
機構願景:建設農業物種分子育種核心技術支撐平台,打造生物農業經濟新型產業鏈,成為中國新生物經濟的技術引擎。
品牌大事記
2009年7月 華大方舟生物技術有限公司成立,是世界第一家手工克隆產業化公司。
2010年 農能平台、微生物平台與克隆平台整合成華大基因的生命科學事業部,暨華大農業。 華大基因學院致力於國際化開放辦學,建立「以項目帶學科 、帶產業、帶人才」、在實戰中培養人才的新型教育培養體系,與多家國內外知名高校開展本、碩、博聯合培養計劃,涵蓋非學歷教育和公共教育,培養生物領域科研和產業需要的創新型人才。
機構願景:打造跨領域教學平台,提供優質教育資源,培養生物科學和產業人才,建立適應新生命科學以及未來生物產業和生物經濟發展的創新教育體系。
華大基因學院已和包括華南理工大學,武漢大學,東南大學在內的10餘所知名高校建立了教育合作關系,採用「2.5+1.5+X」或「3+1+X」的模式開展本、碩博聯合培養,同時還與香港中文大學、哥本哈根大學、奧胡斯大學、美國加州大學戴維斯分校等國際知名高校開展碩、博聯合培養計劃,探索創新人才培養方式。
品牌大事記
2011年10月深圳市華大基因學院成立。
2012年 華大基因學院創新班學員在國際遺傳工程機器大賽亞洲賽區中斬獲金牌。 國家基因庫集生物資源樣本庫、生物信息資料庫和生物資源信息網路為一體,儲存和管理中國特有的遺傳資源、生物信息和基因數據,提高中國生命科學研究水平和國際影響力,促進我國生物產業發展。

㈤ 華大基因 BGI 的英文全稱是什麼

Beijing Genomics institution。

華大基因來是一個專門從事生源命科學的科技前沿機構。以學、研、用為主的科研方式。涉及人類、醫學、農業、畜牧、瀕危動物保護等分子遺傳層面的科技研究。

華大基因為消除人類病痛、經濟危機、國家災難、瀕危動物保護、縮小貧富差距等方面提供分子遺傳層面的技術支持。華大基因有科教、科研、科普、科用四大支柱,1999年9月9日,隨著"國際人類基因組計劃1% 項目"的正式啟動,北京華大基因研究中心在北京正式成立。

(5)華大基因數據分析平台擴展閱讀:

華大基因自1999年成立以來,足跡遍布全球五十多個國家,業務覆蓋了科技、健康、農業等多個領域,致力於為全球夥伴提供先進的測序服務。

根據業務需要,華大基因在全球分布四大片區,分別為中國內地、亞太、南北美、歐非,除在主要城市設立分部外,還有多個業務中心、代表處,各片區依託華大基因先進的測序和檢測技術、高效的信息分析能力、豐富的生物資源、多學科結合的生物科研體系,為當地的科研工作者提供創新性生物研究服務,為當地民眾提供生物科技在醫療、農業、環境等領域的應用服務。

㈥ 華大科技和華大基因什麼關系

華大基因科技服務有限公司(簡稱華大科技)是全球領先的基因組學研究機構—華大基因旗下的子公司。
華大科技(全稱深圳華大基因科技服務有限公司)是華大基因旗下的子公司。
秉承 「科技合作與服務」的產業理念,於2012年4月成立。基於華大基因豐富的科研經驗和先進的技術成果,華大科技建立了先進的科研平台、嚴格的質量體系、標准化和個性化的數據分析以及優質的服務流程,為投身於生物、農業、醫葯等生命科學領域的研究人員提供科研合作與服務。華大科技總部位於中國深圳,共有1500位員工,服務網路已經遍布全球,在歐洲、美洲、亞太地區均設立了業務中心、分部及辦事處。
憑借全球領先的大規模測序計算平台和先進的生物信息分析技術,依託人類健康、葯物研發、動植物研究、分子育種、微生物研究等多個領域合作夥伴,華大科技為一系列大型基因組科研計劃和國際合作項目提供了傑出的科研服務,例如:國際千人基因組計劃、糖尿病關聯基因及變異研究、國際癌症基因組計劃、小麥、玉米、桑蠶等動植物基因組計劃、人體腸道微生物基因組研究計劃、以及人類基因組和家蠶基因組甲基化研究等。2012年營業額達6.5億人民幣,截至12年12月已有20000多位合作夥伴、4000多家合作單位,並參與發表了250餘篇科研論文,其中在Science、Nature等頂級期刊上發表學術論文40餘篇。

㈦ 第二代高通量測序都有哪些平台

Illumina公司的Solexa測序平台,目前主流的型號的HiSeq-2500,以及Hiseq-2000,數據通量在每張Flow cell 300G數據,每次最多可以上2張Flow cell,單張Flow cell運行時間大約在11天左右。讀長通常是100BP,據說近期有了長度上的突破。還有一個型號是MiSeq,該機器運行通量較小,但是讀長大約在150BP以上,常用於微生物檢測,而且該型號獲得FDA認證,可以進行臨床樣本的檢測。Solexa的錯誤類型主要是顛換。
羅氏454平台,主要特點是測序長度很長,目前大於1K的測序沒有什麼難度了,比較適合基因組測序,用於搭建基因組框架,也常用於微生物基因組測序。該平台主要的錯誤類型是插入缺失。
ABI的SoLID平台,聽說該平台不在維護了,故而不再描述。
Life的Ion torrent平台,目前主要有2種型號,較早的一個型號是PGM,該測序儀原理類似於454測序,與454不同的是,454是化學反應發光進行檢測,而PGM是半導體測序,檢測H離子,如果發生了鹼基互補配對,那麼高能磷酸鍵就會釋放H離子,導致電位變化,從而根據已知加入的鹼基,就可以判斷待測序列是否與已知加入的鹼基發生互補,從而達到測序目的,測序長度可以達到400BP,主要用於微生物的檢測,錯誤類型也是插入缺失錯誤。最新的型號是IonProton,該機器與PGM測序原理一致,但是測序通量由PGM的1G數據上升至10G數據,測序精度也較PGM有大幅度提升,測序時間大約是1天。
PacBio的單分子三代測序,該測序儀最大的特點就是測序長度比454更長,更加有利於基因組的拼接工作,有些較小的微生物可以直接將基因組測通成環狀。

㈧ 基因檢測十大公司排名有哪些

國內基因檢測十大公司排名分別有華大基因BGI、貝瑞和康、葯明康德、博奧生物、達安基因、華因康HYK、碳雲iCarbonX、西比曼CBMG、中源協和、安諾優達ANOROAD,以下是較好的公司介紹:

1、華大基因BGI

華大基因屬於深圳華大基因科技有限公司旗下的基因檢測機構,成立於1999年從事高端儀器研發和製造以及基因組研發等領域在國內基因檢測十大公司排名第一主要應用於資源保存以及醫學健康等多個領域造福於廣大市民。

是專門從事生命科學的科技前沿機構。以學、研、用為主的科研方式。涉及人類、醫學、瀕危動物保護等分子遺傳層面的科技研究。

3、葯明康德

葯明康德屬於上海葯明康德新葯開發有限公司旗下品牌,公司是成立於2000年主要以生物技術和制葯以及醫療器材為一體的研發技術平台公司主要業務有生物分析、基因組服務、生物制劑生產、葯物代謝等多個領域的研發與服務。

4、博奧生物

公司以生物晶元為核心技術平台,擁有研發、生產、銷售以及全國第三方獨立醫學檢驗所服務為一體的大醫學完整產業鏈,並響應國家關於「預防為主」的健康方針,將現代醫學與中國傳統醫學緊密結合,打造出集健康產品、健康管理和醫療康復於一體的大健康產業版塊。

迄今,博奧生物在國內已經形成了北京、上海、重慶、成都等大型產業化基地,並形成了以北京博奧晶典生物技術有限公司為核心的產業化平台。

5、達安基因

達安基因屬於中山大學達安基因股份有限公司旗下品牌,公司成立於1988年是一家集臨床檢驗試劑和儀器研發銷售的一個生物醫葯公司。2004年在上海上市在國內基因檢測十大公司排名第五擁有大量的醫學專家以及專業的技術為客戶提供專業的服務。

㈨ 華大基因無創DNA網上怎麼查結果

你指的是無創產前基因檢測吧,該技術只需採集5mL孕婦靜脈血,從中提取源於血漿的游離DNA,採用新一代高通量測序技術,結合生物信息分析,即可准確得出胎兒發生染色體非整倍體,即21-三體綜合征(唐氏綜合征)、18-三體綜合征(愛德華氏綜合征)、13-三體綜合征(帕陶氏綜合征)的風險率。無創是指對孕婦和寶寶沒有創傷性,很安全。

㈩ 華大基因慕序平台的認證課程質量如何

我買的是生物信息分析系列的課程,課程體系還是很完整的,內容呈現也精彩,可惜的是缺少實操的平台,得自己搭建,不過我已經考核通過初級,並且拿到了初級的生物信息分析員的認證證書,至於含金量聽說面試相關行業的時候會加分,因為我還沒換工作所以目前還不是很清楚,希望對你有幫助。

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