rda分析

❶ 使用Canoco5.0進行RDA分析中問題求助

如果只有一個響應變數數據，而沒預測器（解釋變數），我們僅僅需要、也只能歸納這個變數的分布特徵（如通過直方圖、中值，標准差、四分位極差等）。如果有多個響應變數，依然沒有解釋變數，我們可以用排序（間接梯度分析）來分析數據，例如可以用主成分分析（PCA）、對應分析（CA）、去趨勢對應分析（DCA）和非度量多維尺度分析（NMDS），當然也可以用等級分類，如聚類的方法將樣方分為有區別的幾類。
如果我們有一個或多個的解釋變數，要分析一個響應變數，可以用廣義的回歸模型，包括傳統的回歸模型和方差分析、協方差分析。這類分析統稱為一般線性模型（general linear model），最近在一般線性模型基礎上，發展出了廣義線性模型（generalizedlinear models, GLM）和廣義可加模型(generalized additivemodels, GAM)。有關這回歸模型更多的信息，我們將在第8章討論。
如果有多個響應變數需要分析，解釋變數一個或多個，我們可以通過直接梯度排序來分析解釋變數與多個響應變數（群落學里通常是物種）之間的關系。常用的有冗餘分析（RDA）和典範對應分析（CCA）等排序技術。

你的問題裡面氮源算是解釋變數，產生的菌種屬於相應變數。如果你測定的菌種指標為多個，我感覺你就用canoco做一個CCA應該就行了（還有，這種方式應用在生態上只是較多而已，但用在你的實驗上應該沒什麼問題）。CCA是首先針對你的菌種進行排序，然後再與氮源進行線性結合；當然，如果你測定的菌種指標只有一個，那就用SPSS之類的簡單軟體分別進行線性回歸，然後看哪個擬合的結果（r）好就行了。祝早日發表。

❷ 微生物多樣性中rda分析是什麼意思

簡單說即微物豐富程度專業說微物群落結構與性微物群落結構比例細菌某態位通許同種類微物真菌等微物性佔比例

❸ RDA和CCA分析中環境因子和物種相關性達到1是什麼意思下圖如何分析

請問樓主你這個圖是怎麼做出來的呀

❹ 什麼是質譜中的RDA反應求給一個准確的定義

RDA（逆-狄爾斯-阿爾德反應）裂解，是質譜裂解規律較常見的一種，由含有一個環內雙鍵的六元環高溫下分解成共軛雙烯與烯烴或炔烴，是一個協同反應。反應式如下：

❺ 在營養與食品衛生學中，RDA DRL EAR RNI AI UL 分別是什麼含義

1、RDA，Recommended Daily Allowance：每日膳食中營養素供給量；

2、DRL ：日推薦最低攝入量。

3、EAR，Estimated Average Requirement：平均需要量，EAR是根據個體需要量的研究資料制訂的；是根據某些指標判斷可以滿足某一特定性別，年齡及生理狀況群體中50％個體需要量的攝入水平。這一攝入水平不能滿足群體中另外50％個體對該營養素的需要。EAR是制定RDA的基礎。

4、RNI，Recommended Nutrient Intake，推薦攝入量。

RNI的主要用途是作為個體每日攝入該營養素的目標值。RNI是以EAR為基礎制訂的。如果已知EAR的標准差，則RNI定為EAR加兩個標准差，即RNI = EAR+2SD。如果關於需要量變異的資料不夠充分,不能計算SD時，一般設EAR的變異系數為10%，這樣 RNI = 1.2 × EAR。

5、AI，Adequate Intakes，適宜攝入量 。

在個體需要量的研究資料不足不能計算EAR，因而不能求得RNI時,可設定適宜攝入量(AI)來代替RNI。AI是通過觀察或實驗獲得的健康人群某種營養素的攝入量。例如純母乳喂養的足月產健康嬰兒，從出生到4—6個月，他們的營養素全部來自母乳。母乳中供給的營養素量就是他們的AI值,AI的主要用途是作為個體營養素攝入量的目標。

6、UL，Tolerable Upper Intake Level，可耐受最高攝入量

UL是平均每日可以攝入某營養素的最高量。這個量對一般人群中的幾乎所有個體都不至於損害健康。如果某營養素的毒副作用與攝入總量有關。則該營養素的UL是依據食物，飲水及補充劑提供的總量而定。如毒副作用僅與強化食物和補充劑有關。則UL依據這些來源來制定。

(5)rda分析擴展閱讀：

健康成人在普通生活及勞動條件下，按照機體需要進食，其體重應經常維持在恆定水平。體重恆定，說時能量代謝平衡。因此可通過計算每日攝取的食物所提供的能量，並觀察體重的變化來確定能量消耗量。

一般體重每增加1kg，意味著體內儲存25 - 33MJ（6000 - 8000kcal）能量。

一般體重每下降1kg，意味著體內多消耗25 - 33MJ（6000 - 8000kcal）能量。

❻ 質譜中的RDA裂解，求詳解

逆狄爾斯-阿德爾反應(Retro Diels-Alder reaction, RDA反應)

在有機反應中由Diels-Alder反應，即1,3-丁二烯和乙烯縮合產生一個六元環烯化合物。在質譜中出現的是它的逆反應(RDA反應)，即由一個六元環烯化合物裂解生成一個雙烯化合物和乙烯分子。

逆狄爾斯-阿德爾反應在許多化合物的結構測定中特別重要。在帶有雙鍵的脂環化合物、生物鹼、萜類、甾體和黃酮等的質譜上經常可以看到RDA反應產生的離子峰。RDA反應是以雙鍵為裂解反應的起點。

❼ 組成RDA的基本成分

DA/CCA分析

RDA或者CCA是基於對應分析發展而來的一種排序方法，將對應分析與多元回歸分析相結合，每一步計算均與環境因子進行回歸，又稱多元直接梯度分析。此分析是主要用來反映菌群與環境因子之間關系。RDA是基於線性模型，CCA 是基於單峰模型。分析可以檢測環境因子、樣品、菌群三者之間的關系或者兩兩之間的關系。
RDA或CCA模型的選擇原則：先用species-sample 數據（97%相似性的樣品OTU 表）做DCA 分析，看分析結果中Lengths of gradient 的第一軸的大小，如果大於4.0，就應該選CCA，如果3.0-4.0 之間，選RDA 和CCA均可，如果小於3.0，RDA 的結果要好於CCA。
軟體：PC-ORD或是CANOCO軟體作圖。
參考文獻：
Sheik CS, Mitchell TW, Rizvi FZ, Rehman Y, Faisal M, et al. (2012) Exposure of Soil Microbial
Communities to Chromium and Arsenic Alters Their Diversity and Structure. PLoS ONE 7(6): e40059.doi:10.1371/journal.pone.0040059.
例圖：

基於物種信息進行RDA /CCA分析

註：圖中數字表示樣品名，不同顏色或形狀表示不同環境或條件下的樣本組；箭頭表示環境因子；圖中藍色上三角表示不同屬的細菌；物種與環境因子之間的夾角代表物種與環境因子間的正、負相關關系（銳角：正相關；鈍角：負相關；直角：無相關性）；由不同的樣本向各環境因子做垂線，投影點越相近說明樣本間該環境因子屬性值越相似，即環境因子對樣品的影響程度相當。

❽ rda分析中怎麼通過蒙特卡羅檢驗對環境變數進行自動篩選

環境變數類似於DOS的PATH命令，就是將特定的路徑存入系統緩存中，當需要運行一些程序時，系統會先從當前路徑開始尋找運行，如果找不到，會進入PATH指定的路徑尋找該文件並運行。 WINDOWS下的環境變數同理，如你點開始 運行 然後運行一些命令如msconfig就會進入該程序因為MSCONFIG所在的文件夾在環境變數中已經預置過了，如果你敲入的命令不在環境變數的設置路徑中就會提示無法運行。這時你只要將此路徑添入到環境變數中就可以在開始運行中執行.再點新建，把刪掉的加上去就可以了！

❾ 關於營養學中的 ERA RNI RDA的含義

EAR=平均需要量，滿足50%人群的需要；
RNI=推薦攝入量，滿足97~98%人群的需要，是個體攝入量目標；
AI=適宜攝入量，滿足100%人群需要；
UL=可耐受最高攝入量，不至於有損人體健康
就這幾個，其他都是過時的啦，營養學課上講的