⑴ 想问一下对应分析的散点图除了SPSS还有什么软件可以做具体方法是什么。谢谢
很多软件都可以做,比如sas,r
⑵ 怎么用spss做对应分析
在线SPSS「SPSSAU」问卷研究中【对应分析】功能可一键得到分析结果及对应图。
⑶ 利用spss进行多尺度对应分析时,得到的如下结果,请问该图代表什么意义
可以认为相关性是越大的,但是这样来解释的话本人感觉有缺陷。首先,维度1、2可以理解为通过主成分分析得到的两个主因子,因此这两个维度的含义需要参照维度得分来解释,而维度得分恰好就是上面二维图像的横纵坐标。若坐标值(图中的点)即变量,距离原点越远,说明对应的主成分受此变量的影响较大,或者说主成分的方差受此变量的方差影响较大,而统计学中的方差都可以理解为信息的含量,因此该维度包含此变量的信息较多。当然,在图像中相聚越近的点,说明他们的相关性是比较强的。
下面解释你提出的问题1:为什么我认为夹角越小相关性越大这种解释有缺陷,举个比较极端的例子,在所有射线的出发点0处若有变量的话,那么它与所有变量的夹角都是0,显然该变量是不能与所有的变量均强相关的。
问题2:夹角的含义如果非要进行解释的话,那么只能通过解释维度2来说明。例如q1,4与q1,11这两个点,相聚较近且夹角较小,相聚较近说明这两个变量的相关性较强。如果维度2有经济含义的话,那么夹角较小,说明他们分别对维度2的贡献相差不大。
问题3:如果问到维度1、2应该如何解释,那么必须通过主成分分析的结果来给主成分赋予具体的经济含义。比如维度1中变量x1、x2的系数绝对值较大,那么说明维度1主要解释了x1和x2的信息,若x1是住房面积,x2是小区物业费的话,那么维度1主要衡量了该小区的住房水平,因此就可以给维度赋予这样的经济含义。给不同的维度分别赋予一定的经济含义后就可以进行解释了。
受本人水平所限,当下能给你作出的解释主要有这些,希望能报到你。如果还不理解,可以找本多元统计的教材看看主成分分析、因子分析及对应分析这三个章节,绝对会令你茅塞顿开。。谢谢。
⑷ 对应分析的结果如何看怎么解释意义是什么
什么叫对应分析?
⑸ 用spss做对应分析图为什么有网格呢
因为spss做做对应分析图有什么网络有有什么网格,这应该是正常的网格
⑹ 对应分析法的对应分析作用
对应分析的基本思想是将一个联列表的行和列中各元素的比例结构以点的形式在较低维的空间中表示出来。它最大特点是能把众多的样品和众多的变量同时作到同一张图解上,将样品的大类及其属性在图上直观而又明了地表示出来,具有直观性。另外,它还省去了因子选择和因子轴旋转等复杂的数学运算及中间过程,可以从因子载荷图上对样品进行直观的分类,而且能够指示分类的主要参数(主因子)以及分类的依据,是一种直观、简单、方便的多元统计方法。
对应分析法整个处理过程由两部分组成:表格和关联图。对应分析法中的表格是一个二维的表格,由行和列组成。每一行代表事物的一个属性,依次排开。列则代表不同的事物本身,它由样本集合构成,排列顺序并没有特别的要求。在关联图上,各个样本都浓缩为一个点集合,而样本的属性变量在图上同样也是以点集合的形式显示出来。
⑺ spss系统聚类图怎么看
聚类类别不是唯一的,建议可以单独画一条垂直线,然后对应查看分成几个类别,以及每个类别与分析项的对应关系。
另外可以看下SPSSAU的帮助手册,里面有详细的说明。
⑻ 什么是对应分析其统计思想是什么
对应分析也称关联分析、R-Q型因子分析,是近年新发展起来的一种多元相依变量统计分析技术,通过分析由定性变量构成的交互汇总表来揭示变量间的联系。可以揭示同一变量的各个类别之间的差异,以及不同变量各个类别之间的对应关系。
对应分析的基本思想是将一个列联表的行和列中各元素的比例结构以点的形式在较低维的空间中表示出来。对应分析主要应用在市场细分、产品定位、地质研究以及计算机工程等领域中。
原因在于,它是一种视觉化的数据分析方法,它能够将几组看不出任何联系的数据,通过视觉上可以接受的定位图展现出来。
(8)对应分析的图怎么看扩展阅读
对应分析法整个处理过程由两部分组成:表格和关联图。对应分析法中的表格是一个二维的表格,由行和列组成。每一行代表事物的一个属性,依次排开。列则代表不同的事物本身,它由样本集合构成,排列顺序并没有特别的要求。
在关联图上,各个样本都浓缩为一个点集合,而样本的属性变量在图上同样也是以点集合的形式显示出来。它最大特点是能把众多的样品和众多的变量同时作到同一张图解上,将样品的大类及其属性在图上直观而又明了地表示出来,具有直观性。
⑼ correlation heatmap 图怎么分析
稀释性曲线(Rarefaction Curve)采用对测序序列进行随机抽样的方法,以抽到的序列数与它们所能代表OTU的数目构建曲线,即稀释性曲线。当曲线趋于平坦时,说明测序数据量合理,更多的数据量对发现新OTU的边际贡献很小;反之则表明继续测序还可能产生较多新的OTU。横轴:从某个样品中随机抽取的测序条数;"Label 0.03" 表示该分析是基于OTU 序列差异水平在0.03,即相似度为97% 的水平上进行运算的,客户可以选取其他不同的相似度水平。纵轴:基于该测序条数能构建的OTU数量。曲线解读:Ø 图1中每条曲线代表一个样品,用不同颜色标记;Ø 随测序深度增加,被发现OTU 的数量增加。当曲线趋于平缓时表示此时的测序数据量较为合理。2. Shannon-Wiener 曲线反映样品中微生物多样性的指数,利用各样品的测序量在不同测序深度时的微生物多样性指数构建曲线,以此反映各样本在不同测序数量时的微生物多样性。当曲线趋向平坦时,说明测序数据量足够大,可以反映样品中绝大多数的微生物物种信息。横轴:从某个样品中随机抽取的测序条数。纵轴:Shannon-Wiener 指数,用来估算群落多样性的高低。Shannon 指数计算公式:其中,Sobs= 实际测量出的OTU数目;ni= 含有i 条序列的OTU数目;N = 所有的序列数。曲线解读:Ø 图2每条曲线代表一个样品,用不同颜色标记,末端数字为实际测序条数;Ø 起初曲线直线上升,是由于测序条数远不足覆盖样品导致;Ø 数值升高直至平滑说明测序条数足以覆盖样品中的大部分微生物。3.Rank-Abundance 曲线用于同时解释样品多样性的两个方面,即样品所含物种的丰富程度和均匀程度。物种的丰富程度由曲线在横轴上的长度来反映,曲线越宽,表示物种的组成越丰富;物种组成的均匀程度由曲线的形状来反映,曲线越平坦,表示物种组成的均匀程度越高。横轴:OTU 相对丰度含量等级降序排列。纵轴:相对丰度比例。曲线解读:Ø 图3与图4中每条曲线对应一个样本(参考右上角图标);Ø 图3与图4中横坐标表示的是OTU(物种)丰度排列顺序,纵坐标对应的是OTU(物种)所占相对丰度比例(图3为相对百分比例,图4为换算后Log值),曲线趋于水平则表示样品中各物种所占比例相似;曲线整体斜率越大则表示样品中各物种所占比例差异较大。4. 样本群落组成分析:多样本柱状图/ 单样本饼状图 根据分类学分析结果,可以得知一个或多个样品在各分类水平上的物种组成比例情况,反映样品在不同分类学水平上的群落结构。柱状图(图5)横轴:各样品的编号。纵轴:相对丰度比例。图标解读:Ø 颜色对应此分类学水平下各物种名称,不同色块宽度表示不同物种相对丰度比例;Ø 可以在不同分类学水平下作图分析。饼状图(图6)在某一分类学水平上,不同菌群所占的相对丰度比例。不同颜色代表不同的物种。5. 样品OTU 分布Venn 图用于统计多个样品中共有或独有的OTU数目,可以比较直观地表现各环境样品之间的OTU 组成相似程度。不同样品用不同颜色标记,各个数字代表了某个样品独有或几种样品共有的OTU 数量,对应的OTU编号会以EXCEL 表的形式在结题报告中呈现。分析要求单张分析图,样本分组至少两个,最多5 个。Ø 默认设置为97% 相似度水平下以OTU 为单位进行分析作图。6. Heatmap 图用颜色变化来反映二维矩阵或表格中的数据信息,它可以直观地将数据值的大小以定义的颜色深浅表示出来。将高丰度和低丰度的物种分块聚集,通过颜色梯度及相似程度来反映多个样品在各分类水平上群落组成的相似性和差异性。相对丰度比例:热图(图8)中每小格代表其所在样品中某个OTU 的相对丰度。以图8为例,红框高亮的小格所对应的信息为:样本(R11-1Z)中OTU(OTU128)的相对丰度比例大概为0.2%。丰度比例计算公式(Bray Curtis 算法):其中,SA,i = 表示A样品中第i个OTU所含的序列数SB,i = 表示B样品中第i个OTU所含的序列数样品间聚类关系树:进化树表示在选用成图数据中,样本与样本间序列的进化关系(差异关系)。处于同一分支内的样品序列进化关系相近。物种/OTU 丰度相似性树:丰度相似性树表示选用成图的数据中样品与样品中的OTU 或序列在丰度上的相似程度。丰度最相近的会分配到同一分支上。客户自定义分组:根据研究需求对菌群物种/OTU 研究样本进行二级分组Ø 二级物种/OTU 分组:将下级分类学水平物种或OTU 分配到对应的上级分类学水平,以不同颜色区分;Ø 二级样品分组:根据研究需要,对样品进行人为的分组,以不同颜色区分。7. 主成分分析PCA (Principal Component Analysis)在多元统计分析中,主成分分析是一种简化数据集的技术。主成分分析经常用于减少数据集的维数,同时保持数据集中对方差贡献最大的特征,从而有效地找出数据中最“主要”的元素和结构,去除噪音和冗余,将原有的复杂数据降维,揭示隐藏在复杂数据背后的简单结构。通过分析不同样品的OTU 组成可以反映样品间的差异和距离,PCA 运用方差分解,将多组数据的差异反映在二维坐标图上,坐标轴为能够最大程度反映方差的两个特征值。如样品组成越相似,反映在PCA图中的距离越近。横轴和纵轴:以百分数的形式体现主成分主要影响程度。以图9为例,主成分1(PC1)和主成分2(PC2)是造成四组样品(红色,蓝色,黄色和绿色)的两个最大差异特征,贡献率分别为41.1% 和27.1%。十字交叉线:在图9中作为0 点基线存在,起到辅助分析的作用,本身没有意义。图例解读:Ø PCA 分析图是基于每个样品中所含有的全部OTU 完成的;Ø 图9中每个点代表了一个样本;颜色则代表不同的样品分组;Ø 两点之间在横、纵坐标上的距离,代表了样品受主成分(PC1 或 PC2)影响下的相似性距离;Ø 样本数量越多,该分析意义越大;反之样本数量过少,会产生个体差异,导致PCA分析成图后形成较大距离的分开,建议多组样品时,每组不少于5个,不分组时样品不少于10个;Ø 图10中的圆圈为聚类分析结果,圆圈内的样品,其相似距离比较接近。8. RDA/ CCA 分析图基于对应分析发展的一种排序方法,将对应分析与多元回归分析相结合,每一步计算均与环境因子进行回归,又称多元直接梯度分析。主要用来反映菌群与环境因子之间的关系。RDA 是基于线性模型,CCA是基于单峰模型。分析可以检测环境因子、样品、菌群三者之间的关系或者两两之间的关系。横轴和纵轴:RDA 和CCA 分析,模型不同,横纵坐标上的刻度为每个样品或者物种在与环境因子进行回归分析计算时产生的值,可以绘制于二维图形中。图例解读:Ø 冗余分析可以基于所有样品的OTU作图,也可以基于样品中优势物种作图;Ø 箭头射线:图11中的箭头分别代表不同的环境因子(即图中的碳酸氢根离子HCO3-,醋酸根离子AC-等,图中的其它环境因子因研究不同代表的意义不同,因此不再赘述);Ø 夹角:环境因子之间的夹角为锐角时表示两个环境因子之间呈正相关关系,钝角时呈负相关关系。环境因子的射线越长,说明该影响因子的影响程度越大;Ø 图11中不同颜色的点表示不同组别的样品或者同一组别不同时期的样品,图中的拉丁文代表物种名称,可以将关注的优势物种也纳入图中;Ø 环境因子数量要少于样本数量,同时在分析时,需要提供环境因子的数据,比如 pH值,测定的温度值等。9. 单样品/ 多样品分类学系统组成树根据NCBI 提供的已有微生物物种的分类学信息数据库,将测序得到的物种丰度信息回归至数据库的分类学系统关系树中,从整个分类系统上全面了解样品中所有微生物的进化关系和丰度差异。单样品图(图12):可以了解单样品中的序列在各个分类学水平上的分布情况。图例解读:Ø 图12中不同的层次反映不同的分类学水平;Ø 分支处的圆面积说明了分布在该分类学水平,且无法继续往下级水平比对的序列数量,面积越大,说明此类序列越多;Ø 每个分支上的名词后面的两组数字分别表示比对到该分支上的序列数和驻留在该节点上的序列数;Ø 图13中为某单一水平物种分布情况,并非是序列分布。多样品图(图14):比对多个样品在不同分类学分支上序列数量差异。图例解读:Ø 比对不同样品在某分支上的序列数量差异,通过带颜色的饼状图呈现,饼状图的面积越大,说明在分支处的序列数量越多,不同的颜色代表不同的样品。Ø 某颜色的扇形面积越大,说明在该分支上,其对应样品的序列数比其他样品多。Ø 多样品在做该分析时,建议样品数量控制在10个以内,或者将重复样本数据合并成一个样本后,总样品数在10个以内。10.系统发生进化树在分子进化研究中,基于系统发生的推断来揭示某一分类水平上序列间碱基的差异,进而构建进化树。
⑽ 在spss里进行多元对应分析,不出联合图,只出这个提示是什么意思
如果你数据没错的话,可能你模块的授权没有拿到、换一个验证码试试。