上海二代测序诊断

1. 常见二代测序的3种测序方式的共同点有哪些

“普通的基因测序”应该是指“常规DNA测序”吧，是用Sanger法（也就是双脱氧法）进行测序的方法，目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 进行的自动测序，基本上可以做到600bp-800bp的读长。
高通量测序的概念其实是一个相对的概念，在2000年的时候，3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序，是相对手工测序或者跑平板胶来说的。
不过到2005年以后，高通量测序就改指第二代测序（Next generation sequencing），454、Solexa(后改为Illumina）和SOLiD等第二代测序，比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍，甚至上亿倍，所以称为高通量测序。
NGS的特点主要有：
1、通量高。一个RUN能产生500Mb-600Gb的数据量。
2、读长相对较短。454(约400-500bp)，llumina（100-250bp），SOLiD（75-100）。
3、单位数据的成本非常低。现在很多项目测序的费用。已经非常低。生物信息分析成本变得更为重要了。

2. 二代测序的具体介绍

第二代测序技术的核心思想是边合成边测序（Sequencing by Synthesis)，即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列，现有的技术平台主要包括Roche/454 FLX、Illumina/Solexa Genome Analyzer和Applied Biosystems SOLID system。这三个技术平台各有优点，454 FLX的测序片段比较长，高质量的读长（read）能达到400bp；Solexa测序性价比最高，不仅机器的售价比其他两种低，而且运行成本也低，在数据量相同的情况下，成本只有454测序的1/10；SOLID测序的准确度高，原始碱基数据的准确度大于99.94%，而在15X覆盖率时的准确度可以达到99.999%，是目前第二代测序技术中准确度最高的。
更多内容详见网络：http://ke..com/view/4990239.htm

3. 二代测序的具体流程

DNA提取-打断-末端修复-add A-加接头-PCR-上机检测！

4. 基因检测是做什么的上海哪家做这个做得比较好

基因检测是通过血液、其他体液或细胞对DNA进行测序的技术。可以诊断疾病，也可以用于疾病风险的预测。
目前上海做基因检测的公司有很多，选择哪一家基因检测公司，要看个人需求，和所需要检测的项目，建议选择正规专业检测机构来做，比如美吉医学检验所。

5. 听说基因管家用第二代测序技术做基因检测准确率可以到99.5%，这是真的吗

是的，第二代基因测序技术可以解读30亿的碱基，数据量相当于60GB的“天书”（打印成册相当于100本牛津大辞典），对个体携带的20000+个基因进行分析解读，实现了真正意义上的个人基因组的全面检测，准确率达到了99.5%.

6. 国内有没有RNAseq、二代测序做的好的公司，推荐一个，感觉售后分析都很差

是的，国内做这个实验的公司挺多，不过服务大多不怎么样。可以去上海生因生物做。我做过两次，他们的比较专业。服务特别好。问题解决的很快。分析上的问题几乎全部都给你解决。他们公司免费提供数据上传GEO一类的服务。我之前在别的公司测的，都不提供。我也不会怎么传。他们公司完全不操心，直接上传好。

7. 上海哪里有做全基因组测序检测靠谱的

全基因组测序不同于常规测序只测序部分碱基对，而是360°检测500种疾病风险，并结合功能医学、再生医学、抗衰老医学进行健康管理及疾病预防。目前主流的是上海WA臻景医疗。疾病解析-就医指导-定制膳食指南-定制生活方式-给家人健康建议。虽然基因风险不可改变，但可以改变生活方式，仍然保持健康。
希望可以帮到你

8. DNA 的 1代测序，2代测序，3代测序的区别是什么啊

1. 第一代测序：指双脱氧末端终止法，扩增后通过毛细管电泳读取序列，每次获取数据量少。
   

2. 第二代测序：为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。
   

3. 第三代测序：特点是单分子测序，多基于纳米科技，无需扩增，对单分链DNA/RNA直接用合成、降解、通过纳米孔等方式直接测序，核心特点是无需扩增所以成本更低。

(8)上海二代测序诊断扩展阅读：

DNA测序是指分析特定DNA片段的碱基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）与鸟嘌呤的（G）排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。

在基础生物学研究中，和在众多的应用领域，如诊断，生物技术，法医生物学，生物系统学中，DNA序列知识已成为不可缺少的知识。具有现代的DNA测序技术的快速测序速度已经有助于达到测序完整的DNA序列，或多种类型的基因组测序和生命物种，包括人类基因组和其他许多动物，植物和微生物物种的完整DNA序列。

9. 第二代DNA测序技术的操作流程

操作流程如下：

1、测序文库的构建

首先准备基因组，然后将DNA随机片段化成几百碱基或更短的小片段，并在两头加上特定的接头。如果是转录组测序，则文库的构建要相对麻烦些，RNA片段化之后需反转成cDNA，然后加上接头，或者先将RNA反转成cDNA，然后再片段化并加上接头。

2、锚定桥接

Solexa测序的反应在叫做flow cell的玻璃管中进行，flow cell又被细分成8个Lane，每个Lane的内表面有无数的被固定的单链接头。上述步骤得到的带接头的DNA 片段变性成单链后与测序通道上的接头引物结合形成桥状结构，以供后续的预扩增使用。

3、预扩增

添加未标记的dNTP 和普通Taq 酶进行固相桥式PCR 扩增，单链桥型待测片段被扩增成为双链桥型片段。通过变性，释放出互补的单链，锚定到附近的固相表面。通过不断循环，将会在Flow cell 的固相表面上获得上百万条成簇分布的双链待测片段。

4、单碱基延伸测序

在测序的flow cell中加入四种荧光标记的dNTP 、DNA聚合酶以及接头引物进行扩增，在每一个测序簇延伸互补链时，每加入一个被荧光标记的dNTP就能释放出相对应的荧光，测序仪通过捕获荧光信号，并通过计算机软件将光信号转化为测序峰，从而获得待测片段的序列信息。

5、数据分析

这一步严格来讲不能算作测序操作流程的一部分，但是只有通过这一步前面的工作才显得有意义。测序得到的原始数据是长度只有几十个碱基的序列，要通过生物信息学工具将这些短的序列组装成长的Contigs甚至是整个基因组的框架，或者把这些序列比对到已有的基因组或者相近物种基因组序列上，并进一步分析得到有生物学意义的结果。

(9)上海二代测序诊断扩展阅读

第二代测序技术的核心思想是边合成边测序，即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列，现有的技术平台主要包括Roche/454 FLX、Illumina/Solexa Genome Analyzer和Applied Biosystems SOLID system。

Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的基本原理是边合成边测序。在Sanger等测序方法的基础上，通过技术创新，用不同颜色的荧光标记四种不同的dNTP，当DNA聚合酶合成互补链时，每添加一种dNTP就会释放出不同的荧光，根据捕捉的荧光信号并经过特定的计算机软件处理，从而获得待测DNA的序列信息。

10. 老师，在上海开会的时候，听说有两种基因检测的方法：测序法和AMS法，两者怎么解释，有什么不同

测序法分为第一代和第二代，现在有了第三代测序，第一代测序可以针对某些疾病做检测，通量小，第二代测序通量高，可以同时做及时分样本。第三代是单分子测序。
AMS法应该是质谱法，只能针对特定的位点，设计引物检测。那些明确位点的基因可以做。