㈠ 小白求助,华大基因测序结果如何分析
目前国际上通用抄的基因组
De Novo
测序方法有三种:
1. 用Illumina Solexa GA IIx测序仪直接测序;
2. 用Roche GS FLX Titanium直接完成全基因组测序;
3.
用ABI 3730 或Roche GS FLX Titanium测序,搭建骨架,再用Illumina Solexa GA IIx进行深度测序,完成基因组拼接。
㈡ 华大基因的技术平台
华大基因凭借先进的测序和检测技术、高效的信息分析能力、丰富的生物资源,搭建了世界先进的多技术平台,可实现从中心法则到结构与功能的贯穿研究,构建生物技术与信息技术相融合的网络体系。
本着大平台、大资源的方向,华大基因拥有测序平台、质谱平台、信息中心三大技术平台、资源库。在2013年,华大基因还收购了人类全基因组精准测序的创新领导者Complete Genomics,丰富现有多种平台基础上的基因组学研究技术,以强大的平台实力为科研工作者及大众提供服务。 信息中心以实现超大规模生物信息学计算为中心任务,不断提升其在高效能计算、云计算服务能力,为海量数据处理提供创新解决方案。
华大基因拥有深圳、香港、北京、武汉、杭州等数个大型生物信息学超级计算中心,截至2014年5月,总峰值计算能力达到248 Tflops,总内存容量达到46.3TB,总存储能力达到22.7PB。其中位于深圳和香港的集群的峰值计算能力分列国内生物信息领域第一和第二位,有能力为海量生物信息学数据的存储、处理和分析提供稳定而高效的资源保障。
㈢ 深度测序的主要软件有哪些华大基因测序的结果一般要怎么处理
主要有两类,一类是基于overlap graph的组装软件,有CABOG、ARACHNE、RePS、phrap及newbler等; 另一类是基于de bruijn graph的组装软件,有SOAPdenovo、Velvet、ALLPATHS、ABySS等。
说的华大基因测序的主要分析方法要看您做什么了。。。高通量测序现在国内做的人多了去了,如果被人店大欺客的话,可以找我们
㈣ 华大基因的华大品牌
作为以领先的基因科技造福人类为宗旨的生物科技公司,华大基因凭借自身强大的硬件平台和人才资源,在9大领域为全球科研工作者提供创新型生物研究服务,为广大普通民众提供前沿生物科技在医疗、农业、环境等领域的应用服务。 华大基因研究院致力于基因组学、转录组学等多组学方面的公益性研究,研究内容涵盖医疗健康、农业育种、环境等生命科学相关领域,目前主要进行个人基因组、肿瘤、生育健康和动植物分子育种四大项目的研究。
机构愿景:实现基础研究重大技术突破和领先技术开发,成为生物产业发展核心驱动力。
品牌大事记
2007年6月 深圳华大基因研究院成立
2011年7月 华大基因大数据期刊《Giga Science》杂志已经开始接收数据,并公开了首个可引用的数据库—德国大肠杆菌数据库。 华大科技专注于服务生命科学研究者、搭建全产业链服务网络,解决人类社会中的各类健康、能源、环境问题,致力于成为全球生命科学研究机构的首选合作伙伴。
机构愿景:为科学家有效组织科研资源提供方向性信息支持;改善人类健康,保护环境,节约资源;建立全球合作网络,成为知识最重要的生产者。
品牌大事记
2009年8月 华大基因专门成立科技合作事业部,旨在为全球合作伙伴提供科技合作和服务。
2012年4月 华大基因科技服务有限公司正式成立,致力成为全球领先的生物科研解决方案提供者。
业务内容
华大科技依托多种成熟技术平台,服务于生命科学研究的各个领域,为全球从事生命科学研究的科研人员提供高质量的、行业领先的基因组学测序服务、基因分型、转录组学测序服务、表观组学测序服务、蛋白质谱分析服务、Sanger测序及Oligo合成、生物云计算等标准化的生物技术外包服务;除此外,我们还可以依据您的个性化需求提供定制化产品服务以及一站式全套的解决方案(Total Solution)。 华大医学致力于以经济、简便的方式,将全球前沿的多组学科研成果应用于医学检测领域,以期大幅降低出生缺陷率,提高肿瘤等重大疾病的诊疗效果。华大医学已开发出一系列基于多组学技术的检测服务,形成了贯穿生命孕育、出生、发育、成长等全过程的全时全景产品图谱。
品牌口号:我的基因我知道,我的健康我做主
机构使命:控制几种病,造福千万家
品牌大事记
2007年2月, “华大健康(现华大医学)事业部”正式成立;
2012年3月, 临检中心及胎儿与生殖健康中心合并,华大健康(现华大医学)成立;
2014年3月,“华大健康”正式更名为“华大医学”。 华大农业研究范围覆盖植物、动物、微生物、海洋四大领域,现拥有达到国际先进水平、设备/仪器齐全、管理完善的各类生物学和育种实验室、玻璃温室及近千亩的育种基地和产业化基地,致力于推动新兴农业经济发展。
机构愿景:建设农业物种分子育种核心技术支撑平台,打造生物农业经济新型产业链,成为中国新生物经济的技术引擎。
品牌大事记
2009年7月 华大方舟生物技术有限公司成立,是世界第一家手工克隆产业化公司。
2010年 农能平台、微生物平台与克隆平台整合成华大基因的生命科学事业部,暨华大农业。 华大基因学院致力于国际化开放办学,建立“以项目带学科 、带产业、带人才”、在实战中培养人才的新型教育培养体系,与多家国内外知名高校开展本、硕、博联合培养计划,涵盖非学历教育和公共教育,培养生物领域科研和产业需要的创新型人才。
机构愿景:打造跨领域教学平台,提供优质教育资源,培养生物科学和产业人才,建立适应新生命科学以及未来生物产业和生物经济发展的创新教育体系。
华大基因学院已和包括华南理工大学,武汉大学,东南大学在内的10余所知名高校建立了教育合作关系,采用“2.5+1.5+X”或“3+1+X”的模式开展本、硕博联合培养,同时还与香港中文大学、哥本哈根大学、奥胡斯大学、美国加州大学戴维斯分校等国际知名高校开展硕、博联合培养计划,探索创新人才培养方式。
品牌大事记
2011年10月深圳市华大基因学院成立。
2012年 华大基因学院创新班学员在国际遗传工程机器大赛亚洲赛区中斩获金牌。 国家基因库集生物资源样本库、生物信息数据库和生物资源信息网络为一体,储存和管理中国特有的遗传资源、生物信息和基因数据,提高中国生命科学研究水平和国际影响力,促进我国生物产业发展。
㈤ 华大基因 BGI 的英文全称是什么
Beijing Genomics institution。
华大基因来是一个专门从事生源命科学的科技前沿机构。以学、研、用为主的科研方式。涉及人类、医学、农业、畜牧、濒危动物保护等分子遗传层面的科技研究。
华大基因为消除人类病痛、经济危机、国家灾难、濒危动物保护、缩小贫富差距等方面提供分子遗传层面的技术支持。华大基因有科教、科研、科普、科用四大支柱,1999年9月9日,随着"国际人类基因组计划1% 项目"的正式启动,北京华大基因研究中心在北京正式成立。
(5)华大基因数据分析平台扩展阅读:
华大基因自1999年成立以来,足迹遍布全球五十多个国家,业务覆盖了科技、健康、农业等多个领域,致力于为全球伙伴提供先进的测序服务。
根据业务需要,华大基因在全球分布四大片区,分别为中国内地、亚太、南北美、欧非,除在主要城市设立分部外,还有多个业务中心、代表处,各片区依托华大基因先进的测序和检测技术、高效的信息分析能力、丰富的生物资源、多学科结合的生物科研体系,为当地的科研工作者提供创新性生物研究服务,为当地民众提供生物科技在医疗、农业、环境等领域的应用服务。
㈥ 华大科技和华大基因什么关系
华大基因科技服务有限公司(简称华大科技)是全球领先的基因组学研究机构—华大基因旗下的子公司。
华大科技(全称深圳华大基因科技服务有限公司)是华大基因旗下的子公司。
秉承 “科技合作与服务”的产业理念,于2012年4月成立。基于华大基因丰富的科研经验和先进的技术成果,华大科技建立了先进的科研平台、严格的质量体系、标准化和个性化的数据分析以及优质的服务流程,为投身于生物、农业、医药等生命科学领域的研究人员提供科研合作与服务。华大科技总部位于中国深圳,共有1500位员工,服务网络已经遍布全球,在欧洲、美洲、亚太地区均设立了业务中心、分部及办事处。
凭借全球领先的大规模测序计算平台和先进的生物信息分析技术,依托人类健康、药物研发、动植物研究、分子育种、微生物研究等多个领域合作伙伴,华大科技为一系列大型基因组科研计划和国际合作项目提供了杰出的科研服务,例如:国际千人基因组计划、糖尿病关联基因及变异研究、国际癌症基因组计划、小麦、玉米、桑蚕等动植物基因组计划、人体肠道微生物基因组研究计划、以及人类基因组和家蚕基因组甲基化研究等。2012年营业额达6.5亿人民币,截至12年12月已有20000多位合作伙伴、4000多家合作单位,并参与发表了250余篇科研论文,其中在Science、Nature等顶级期刊上发表学术论文40余篇。
㈦ 第二代高通量测序都有哪些平台
Illumina公司的Solexa测序平台,目前主流的型号的HiSeq-2500,以及Hiseq-2000,数据通量在每张Flow cell 300G数据,每次最多可以上2张Flow cell,单张Flow cell运行时间大约在11天左右。读长通常是100BP,据说近期有了长度上的突破。还有一个型号是MiSeq,该机器运行通量较小,但是读长大约在150BP以上,常用于微生物检测,而且该型号获得FDA认证,可以进行临床样本的检测。Solexa的错误类型主要是颠换。
罗氏454平台,主要特点是测序长度很长,目前大于1K的测序没有什么难度了,比较适合基因组测序,用于搭建基因组框架,也常用于微生物基因组测序。该平台主要的错误类型是插入缺失。
ABI的SoLID平台,听说该平台不在维护了,故而不再描述。
Life的Ion torrent平台,目前主要有2种型号,较早的一个型号是PGM,该测序仪原理类似于454测序,与454不同的是,454是化学反应发光进行检测,而PGM是半导体测序,检测H离子,如果发生了碱基互补配对,那么高能磷酸键就会释放H离子,导致电位变化,从而根据已知加入的碱基,就可以判断待测序列是否与已知加入的碱基发生互补,从而达到测序目的,测序长度可以达到400BP,主要用于微生物的检测,错误类型也是插入缺失错误。最新的型号是IonProton,该机器与PGM测序原理一致,但是测序通量由PGM的1G数据上升至10G数据,测序精度也较PGM有大幅度提升,测序时间大约是1天。
PacBio的单分子三代测序,该测序仪最大的特点就是测序长度比454更长,更加有利于基因组的拼接工作,有些较小的微生物可以直接将基因组测通成环状。
㈧ 基因检测十大公司排名有哪些
国内基因检测十大公司排名分别有华大基因BGI、贝瑞和康、药明康德、博奥生物、达安基因、华因康HYK、碳云iCarbonX、西比曼CBMG、中源协和、安诺优达ANOROAD,以下是较好的公司介绍:
1、华大基因BGI
华大基因属于深圳华大基因科技有限公司旗下的基因检测机构,成立于1999年从事高端仪器研发和制造以及基因组研发等领域在国内基因检测十大公司排名第一主要应用于资源保存以及医学健康等多个领域造福于广大市民。
是专门从事生命科学的科技前沿机构。以学、研、用为主的科研方式。涉及人类、医学、濒危动物保护等分子遗传层面的科技研究。
3、药明康德
药明康德属于上海药明康德新药开发有限公司旗下品牌,公司是成立于2000年主要以生物技术和制药以及医疗器材为一体的研发技术平台公司主要业务有生物分析、基因组服务、生物制剂生产、药物代谢等多个领域的研发与服务。
4、博奥生物
公司以生物芯片为核心技术平台,拥有研发、生产、销售以及全国第三方独立医学检验所服务为一体的大医学完整产业链,并响应国家关于“预防为主”的健康方针,将现代医学与中国传统医学紧密结合,打造出集健康产品、健康管理和医疗康复于一体的大健康产业版块。
迄今,博奥生物在国内已经形成了北京、上海、重庆、成都等大型产业化基地,并形成了以北京博奥晶典生物技术有限公司为核心的产业化平台。
5、达安基因
达安基因属于中山大学达安基因股份有限公司旗下品牌,公司成立于1988年是一家集临床检验试剂和仪器研发销售的一个生物医药公司。2004年在上海上市在国内基因检测十大公司排名第五拥有大量的医学专家以及专业的技术为客户提供专业的服务。
㈨ 华大基因无创DNA网上怎么查结果
你指的是无创产前基因检测吧,该技术只需采集5mL孕妇静脉血,从中提取源于血浆的游离DNA,采用新一代高通量测序技术,结合生物信息分析,即可准确得出胎儿发生染色体非整倍体,即21-三体综合征(唐氏综合征)、18-三体综合征(爱德华氏综合征)、13-三体综合征(帕陶氏综合征)的风险率。无创是指对孕妇和宝宝没有创伤性,很安全。
㈩ 华大基因慕序平台的认证课程质量如何
我买的是生物信息分析系列的课程,课程体系还是很完整的,内容呈现也精彩,可惜的是缺少实操的平台,得自己搭建,不过我已经考核通过初级,并且拿到了初级的生物信息分析员的认证证书,至于含金量听说面试相关行业的时候会加分,因为我还没换工作所以目前还不是很清楚,希望对你有帮助。