❶ 使用Canoco5.0进行RDA分析中问题求助
如果只有一个响应变量数据,而没预测器(解释变量),我们仅仅需要、也只能归纳这个变量的分布特征(如通过直方图、中值,标准差、四分位极差等)。如果有多个响应变量,依然没有解释变量,我们可以用排序(间接梯度分析)来分析数据,例如可以用主成分分析(PCA)、对应分析(CA)、去趋势对应分析(DCA)和非度量多维尺度分析(NMDS),当然也可以用等级分类,如聚类的方法将样方分为有区别的几类。
如果我们有一个或多个的解释变量,要分析一个响应变量,可以用广义的回归模型,包括传统的回归模型和方差分析、协方差分析。这类分析统称为一般线性模型(general linear model),最近在一般线性模型基础上,发展出了广义线性模型(generalizedlinear models, GLM)和广义可加模型(generalized additivemodels, GAM)。有关这回归模型更多的信息,我们将在第8章讨论。
如果有多个响应变量需要分析,解释变量一个或多个,我们可以通过直接梯度排序来分析解释变量与多个响应变量(群落学里通常是物种)之间的关系。常用的有冗余分析(RDA)和典范对应分析(CCA)等排序技术。
你的问题里面氮源算是解释变量,产生的菌种属于相应变量。如果你测定的菌种指标为多个,我感觉你就用canoco做一个CCA应该就行了(还有,这种方式应用在生态上只是较多而已,但用在你的实验上应该没什么问题)。CCA是首先针对你的菌种进行排序,然后再与氮源进行线性结合;当然,如果你测定的菌种指标只有一个,那就用SPSS之类的简单软件分别进行线性回归,然后看哪个拟合的结果(r)好就行了。祝早日发表。
❷ 微生物多样性中rda分析是什么意思
简单说即微物丰富程度专业说微物群落结构与性微物群落结构比例细菌某态位通许同种类微物真菌等微物性占比例
❸ RDA和CCA分析中环境因子和物种相关性达到1是什么意思下图如何分析
请问楼主你这个图是怎么做出来的呀
❹ 什么是质谱中的RDA反应求给一个准确的定义
RDA(逆-狄尔斯-阿尔德反应)裂解,是质谱裂解规律较常见的一种,由含有一个环内双键的六元环高温下分解成共轭双烯与烯烃或炔烃,是一个协同反应。反应式如下:
❺ 在营养与食品卫生学中,RDA DRL EAR RNI AI UL 分别是什么含义
1、RDA,Recommended Daily Allowance:每日膳食中营养素供给量;
2、DRL :日推荐最低摄入量。
3、EAR,Estimated Average Requirement:平均需要量,EAR是根据个体需要量的研究资料制订的;是根据某些指标判断可以满足某一特定性别,年龄及生理状况群体中50%个体需要量的摄入水平。这一摄入水平不能满足群体中另外50%个体对该营养素的需要。EAR是制定RDA的基础。
4、RNI,Recommended Nutrient Intake,推荐摄入量。
RNI的主要用途是作为个体每日摄入该营养素的目标值。RNI是以EAR为基础制订的。如果已知EAR的标准差,则RNI定为EAR加两个标准差,即RNI = EAR+2SD。如果关于需要量变异的资料不够充分,不能计算SD时,一般设EAR的变异系数为10%,这样 RNI = 1.2 × EAR。
5、AI,Adequate Intakes,适宜摄入量 。
在个体需要量的研究资料不足不能计算EAR,因而不能求得RNI时,可设定适宜摄入量(AI)来代替RNI。AI是通过观察或实验获得的健康人群某种营养素的摄入量。例如纯母乳喂养的足月产健康婴儿,从出生到4—6个月,他们的营养素全部来自母乳。母乳中供给的营养素量就是他们的AI值,AI的主要用途是作为个体营养素摄入量的目标。
6、UL,Tolerable Upper Intake Level,可耐受最高摄入量
UL是平均每日可以摄入某营养素的最高量。这个量对一般人群中的几乎所有个体都不至于损害健康。如果某营养素的毒副作用与摄入总量有关。则该营养素的UL是依据食物,饮水及补充剂提供的总量而定。如毒副作用仅与强化食物和补充剂有关。则UL依据这些来源来制定。
(5)rda分析扩展阅读:
健康成人在普通生活及劳动条件下,按照机体需要进食,其体重应经常维持在恒定水平。体重恒定,说时能量代谢平衡。因此可通过计算每日摄取的食物所提供的能量,并观察体重的变化来确定能量消耗量。
一般体重每增加1kg,意味着体内储存25 - 33MJ(6000 - 8000kcal)能量。
一般体重每下降1kg,意味着体内多消耗25 - 33MJ(6000 - 8000kcal)能量。
❻ 质谱中的RDA裂解,求详解
逆狄尔斯-阿德尔反应(Retro Diels-Alder reaction, RDA反应)
在有机反应中由Diels-Alder反应,即1,3-丁二烯和乙烯缩合产生一个六元环烯化合物。在质谱中出现的是它的逆反应(RDA反应),即由一个六元环烯化合物裂解生成一个双烯化合物和乙烯分子。
逆狄尔斯-阿德尔反应在许多化合物的结构测定中特别重要。在带有双键的脂环化合物、生物碱、萜类、甾体和黄酮等的质谱上经常可以看到RDA反应产生的离子峰。RDA反应是以双键为裂解反应的起点。
❼ 组成RDA的基本成分
DA/CCA分析
RDA或者CCA是基于对应分析发展而来的一种排序方法,将对应分析与多元回归分析相结合,每一步计算均与环境因子进行回归,又称多元直接梯度分析。此分析是主要用来反映菌群与环境因子之间关系。RDA是基于线性模型,CCA 是基于单峰模型。分析可以检测环境因子、样品、菌群三者之间的关系或者两两之间的关系。
RDA或CCA模型的选择原则:先用species-sample 数据(97%相似性的样品OTU 表)做DCA 分析,看分析结果中Lengths of gradient 的第一轴的大小,如果大于4.0,就应该选CCA,如果3.0-4.0 之间,选RDA 和CCA均可,如果小于3.0,RDA 的结果要好于CCA。
软件:PC-ORD或是CANOCO软件作图。
参考文献:
Sheik CS, Mitchell TW, Rizvi FZ, Rehman Y, Faisal M, et al. (2012) Exposure of Soil Microbial
Communities to Chromium and Arsenic Alters Their Diversity and Structure. PLoS ONE 7(6): e40059.doi:10.1371/journal.pone.0040059.
例图:
基于物种信息进行RDA /CCA分析
注:图中数字表示样品名,不同颜色或形状表示不同环境或条件下的样本组;箭头表示环境因子;图中蓝色上三角表示不同属的细菌;物种与环境因子之间的夹角代表物种与环境因子间的正、负相关关系(锐角:正相关;钝角:负相关;直角:无相关性);由不同的样本向各环境因子做垂线,投影点越相近说明样本间该环境因子属性值越相似,即环境因子对样品的影响程度相当。
❽ rda分析中怎么通过蒙特卡罗检验对环境变量进行自动筛选
环境变量类似于DOS的PATH命令,就是将特定的路径存入系统缓存中,当需要运行一些程序时,系统会先从当前路径开始寻找运行,如果找不到,会进入PATH指定的路径寻找该文件并运行。 WINDOWS下的环境变量同理,如你点开始 运行 然后运行一些命令如msconfig就会进入该程序因为MSCONFIG所在的文件夹在环境变量中已经预置过了,如果你敲入的命令不在环境变量的设置路径中就会提示无法运行。这时你只要将此路径添入到环境变量中就可以在开始运行中执行.再点新建,把删掉的加上去就可以了!
❾ 关于营养学中的 ERA RNI RDA的含义
EAR=平均需要量,满足50%人群的需要;
RNI=推荐摄入量,满足97~98%人群的需要,是个体摄入量目标;
AI=适宜摄入量,满足100%人群需要;
UL=可耐受最高摄入量,不至于有损人体健康
就这几个,其他都是过时的啦,营养学课上讲的