重测序价格

① 新一代测序中，基因从头测序和重测序有什么区别

基因从头测序也叫做基因de
novo测序，是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组进行测序，然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装，最终获得该物种基因组序列图谱。
重测序是指在已知物种基因组的情况下，对物种内的不同个体或某个个体的不同组织进行基因组重测序，可以在全基因组水平上发现不同个体或组织细胞之间的差异。通过这种方法，可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点（snp），插入缺失位点（indel，insertion
deletion），结构变异位点（sv，structure
variation），拷贝数变异（
number
variation，cnv）等变异信息，从而获得生物群体的遗传特征。
病毒变异率很高，一般不用重测序，可以用de
novo从头测序。

② 300个水稻样本全基因组重测序大概多少钱

全基因组测序，一般考虑测序深度和测序错误率，也就是覆盖几遍，一般要6倍的量，，，还有现在不是太贵，具体你可以问问华大的销售人员。。。

③ 高通量测序和重测序是怎么回事啊哪位高手能赐教

是这样的，高通量测序分为好多种，有不同的平台运作，共同的特点是极高的测序通量，相对于传统测序的96道毛细管测序，高通量测序一次实验可以读取40万到 400万条序列。读取长度根据平台不同从25bp到450bp，不同的测序平台在一次实验中，可以读取1G到14G不等的碱基数，这样庞大的测序能力是传统测序仪所不能比拟的。
重测序就是说，基于第二代测序，也可以是第一代的，对之前的测过序的基因组再测一边，并对个体或者群体样品进行分析。基因组的重测序可以辅助研究者发现单核苷酸多态性位点（SNPs）、拷贝数变异（Copy Number Variation, CNV）、插入（Insertion）、缺失（Deletion）等变异类型，以最廉价的方式将单个参考基因组信息扩增为生物群体的遗传特征。短序列（Short-Reads）与双末端（Paired-End），以及不同插入长度双末端的组合，使我们能够更深入地了解到序列和序列以外的基因组结构变异。

相位，就是说在测序的时候，测序的结果 会出现在电脑上，这个就叫做相位。在深一点就比较专业了，我还没用过第二代测序，也不太清楚。但是， 据我所知相位经常会出现出现“超前”和“延迟”的现象。

④ 为什么 Illumina 最新测序仪能将全基因组测序价格降至 1000 美元

1.测序原理依然是CG一直用的Sequencingbyligation(SBL)而非illumina家明显占优势的Sequencingbysynthesis(SBS)。虽然CG在前一段时间买了SBS的专利，但在这款测序仪上明显没有使用。28bp的读长应该是4个7mer连起来的长度。2.读长是28bp。50xcoverage一个WGS，每年10000个WGS，一个run跑8天来算的话，一个run的通量大概是32.8T，就数据量讲，绝对是测序仪中航母的体量的#当然占地面积更是#。准确度按照官方的话说应该是“unbelievableaccuracy”，大概错误率是1E-6这个级别，显然是比任何面试的测序仪正确率都远远要高。但是请不要忽略了CG这台测序仪的读长只有28bp，而请考虑把illumina的读长从250bp和150bp砍到28bp再比较正确率的情况。3.1先说优势。数据产量巨大，因而单位成本一定很低，适合做人类基因组的重测序。CG打从出生就标榜是“人类基因组重测序的最佳测序平台”。28bp的读长，复杂度低的“人类”基因组（或是外显子组）处理起来尚且算是得心应手。28bp只能做重测序，组装什么的还是撸撸睡吧。而对于NIPT以及类似的技术，测序过程就是“堆砌数据量”，仅需检测拷贝数变化而不关注覆盖度和SNP水平的变异，CG这款新机器可能是非常好的选择（我不是很确定的是，28bp这个长度是否可能对大规模混样而需要许多复杂度较高的barcode什么的造成一定的麻烦）。而类似于未来的面向肿瘤无创早起筛查的游离肿瘤细胞（ctC）检测，游离肿瘤DNA（ctDNA）检测，以及面向产前胎儿基因组测序的胎儿有核红细胞（FNRBC）检测，所测绝大部分数据将是无用数据，CG这种“数据不要钱”的平台的优势可能就会显现。不就是堆数据量么，咱在行。3.2劣势嘛，数据量太大也是一个劣势——凑不满run，一般人根本跑不动。参考HiseqX尴尬的现状。然后读长是硬伤，所以除了“人类”“重测序”以外，几乎没法应用于别的领域了（熊猫那种比人类基因组复杂度还要远低的大概还是可以啦）。以及28bp对pooling时barcode的影响，表示略担心。其他的，参考CG以前的机器，其运行稳定性是个考验，毕竟8天时间不短，反应量数据量都巨大，不知道会不会很容易需要“售后”。

⑤ 基因组测序 和简化基因组测序的区别 价格比较

佳学基因专业，人类基因信息解读和应用。如果您想了解个人基因组信息，请向佳学基因咨询基因组测序质量要求。简化基因组测序降低的一点是基因测序的质量，降低的是准确性。如果测的基因是错的，要它何用。

⑥ 个人全基因组重测序需花费多少钱

人类基因组大小3G， 重测序一般需要测定至少20x以上的数据（数据乘数高的话对于信息分析是有利的），也就是说一般需要测定60G的数据，如果1G按照5000元算的话，需要30万元。
不过要看你的目的，现在illumina推出的my-seq测1个人的好像只需要几万。

⑦ 重测序跟遗传多样性分析有什么区别

基于第二代高通量测序技术，对于有参考序列的物种，针对不同的真菌菌株，可通过全基因组重测序的方法获得全基因组范围内完整的变异信息，讨论群体的遗传结构、影响群体遗传平衡的因素以及物种形成的机制，定位重要性状位点，为后续分子育种打下坚实基础。同时，通过全基因组大样本重测序对真菌重要菌株进行全基因组的基因型鉴定，并与关注的表型数据进行全基因组关联分析（GWAS），找出与关注表型相关的SNP位点，定位性状相关基因。随着测序成本降低和拥有参考基因组序列的物种增多，基因组重测序也成为育种研究中迅速有效的方法之一，在全基因组水平扫描并检测出与重要性状相关的变异位点，具有重大的科研价值和产业价值。

⑧ 新一代测序中，基因从头测序和重测序有什么区别我要做乙肝病毒DNA全长测序，应该选用哪种方法

1、条件不同

从头测序的条件是不依赖于任何物种基因组；重测序的条件是在已知物种基因组的情况下进行的。

2、病毒变异率不同

从头测序是通过拼接和组装的方式获得基因组序列图谱，病毒变异率很低；重测序可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点，插入缺失位点，结构变异位点，拷贝数变异等变异信息，从而获得生物群体的遗传特征。病毒变异率很高。

乙肝病毒在医学上已经测过，只需要做重测序就可以。

(8)重测序价格扩展阅读：

从头测序的原理是生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组寡核苷酸都有固定的起点，但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。

可以区分长度仅差一个核苷酸的不同DNA分子的条件下，对各组寡核苷酸进行电泳分析，只要把几组寡核苷酸加样于测序凝胶中若干个相邻的泳道上。

全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。

SBC将不同梯度插入片段的测序文库结合短序列、双末端进行测序，帮助客户在全基因组水平上扫描并检测与重要性状相关的基因序列差异和结构变异，实现遗传进化分析及重要性状候选基因预测。

⑨ 重测序挖掘基因一般需要多少X的数据

大概需要10-30X的数据

⑩ gwas和全基因组重测序的区别

基于第二代高通量测序技术，对于有参考序列的物种，针对不同的真菌菌株，可通过全基因组重测序的方法获得全基因组范围内完整的变异信息，讨论群体的遗传结构、影响群体遗传平衡的因素以及物种形成的机制，定位重要性状位点，为后续分子育种打下坚实基础。同时，通过全基因组大样本重测序对真菌重要菌株进行全基因组的基因型鉴定，并与关注的表型数据进行全基因组关联分析（GWAS），找出与关注表型相关的SNP位点，定位性状相关基因。随着测序成本降低和拥有参考基因组序列的物种增多，基因组重测序也成为育种研究中迅速有效的方法之一，在全基因组水平扫描并检测出与重要性状相关的变异位点，具有重大的科研价值和产业价值。
近日，Nature Genetics发表的一篇文章就充分利用了微生物基因组测序与以全基因组重测序为基础的全基因组关联分析结合的方法，揭示了裂殖酵母遗传与表型多样性之间的联系。研究者选取裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe作为研究对象，在全球20个国家范围内收集了时间跨度为100年的161个野生株系的S.Pombe，进行了全基因组测序，推测裂殖酵母在公元前340年开始广泛大量出现，祖先种到达美洲的时间为公园1623年。后续研究者又选取223个菌种进行全基因组关联分析，发现至少89个性状表现出一个关联。每个性状最显著的检测到的变异可以解释平均22%的表型差异，且indel的影响比SNP更大。